Como o CPF não é um campo obrigatório no formulário do aluno, e nem sempre há a validação de um cadastro anterior em sistema, por vezes encontramos duplicação de registros.
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O ideal é que, no momento da matrícula, a escola clique na opção '[+] Matricular um novo aluno', somente se não localizar o aluno
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No entanto, caso haja cadastros duplicados, é possível fazer a unificação. Acesse 'Secretaria :: Alunos' e clique em 'Unificar alunos'.

O sistema exibirá pra você uma tela com todos os possíveis cadastros duplicados. Marque aqueles que serão mantidos, quais serão unificados e removidos e quais não se deve alterar.
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Após finalizar as verificações, clique em 'Conferi as informações e desejo prosseguir' e depois em 'Continuar e unificar cadastros'.

Esse recurso não traz todos os possíveis registros duplicados de uma única vez. Talvez seja necessário unificar os que estão sendo exibidos, para que o sistema possa exibir outros cadastros duplicados ao reiniciar o processo.
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No caso de dúvidas, estamos à disposição!